RAPD markers assessment for genetic diversity analysis in Hoplias malabaricus
Keywords:
Trahiras, Genetic diversity, Genetic polymorphismAbstract
The Hoplias malabaricus species, a member of the Erythrinidae family, is found in the Madeira River basin and some studies suggest that it is a species complex. This work aimed to investigate the feasibility of using RAPD-PCR markers to determine the genetic variability of H. malabaricus from three streams in that basin. The work was carried out by PCR using 12 RAPD sequences, of which four were selected for statistical analysis. From the use of specifics softwares was calculated the percentage of polymorphism, similarity and genetic distance between the specimens, as well as the ICP and heterozygosity values. It was possible to observe a high degree of polymorphism (95% of the loci) and the division of the samples into four subgroups, consistent with the collection sites. The data suggest that primers OPB5, OPB7, OPB9 and OPB10 may be useful in the study of genetic diversity among H. malabaricus populations.
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Published
2021-06-27
How to Cite
Faustino Lima, B., Mendonça, A. G. ., Guzman, R. M. R., Santos-Catâneo, D. T. dos ., Dória, C. R. da C., & Pagotto, R. de C. (2021). RAPD markers assessment for genetic diversity analysis in Hoplias malabaricus. South American Journal of Basic Education, Technical and Technological, 6(2), 299–310. Retrieved from https://periodicos.ufac.br/index.php/SAJEBTT/article/view/3018
Issue
Section
Ciências Biológicas
