Um protocolo modificado para isolamento de RNA total de amendoim forrageiro
Palavras-chave:
Extração de RNA total, alto rendimento, alta qualidade, metabólitos secundáriosResumo
O desenvolvimento de protocolos específicos para extração de RNA de alta qualidade são avanços chave em técnicas moleculares para elucidar mecanismos e processos biológicos. O amendoim forrageiro tem significante valor econômico para uso em pastagens consorciadas. Entretanto, é difícil extrair RNA de alta qualidade de amedoim forrageiro devido aos altos conteúdos de taninos, polissacarídeos e outros metabólitos secundários. Aqui, descreve-se um eficiente método para obtenção de RNA total de alta qualidade e alto rendimento que é necessário para análises posteriores do transcriptoma. Essas modificações ajudaram a eliminar os problemas associados com a presença de altas concentrações de metabólitos secundários em folhas de amendoim forrageiro e sem sinais de degradação.
Referências
[2] TERRA, A.B.C.; FLORENTINO, L.A.; REZENDE, A.V.; et al. Forage legumes in pasture recovery in Brazil. Revista de Ciências Agrárias, v.42, n.2, p.305-313, 2019. https://doi.org/10.19084/rca.16016.
[3] EMPRESA BRASILEIRA DE PESQUISA AGROPECUÁRIA. Balanço Social 2018. http://bs.sede.embrapa.br/2018/balancosocialembrapa2018web.pdf, 2019. Accessed on: 01 dec. 2019.
[4] PAULINO, V.T.; BUENO, M.S.; ABDALLA, A.L. Composição química e compostos fenólicos em Arachis pintoi 'Belmonte'. Archivos de zootecnia, v.61, n.236, p.611-614, 2012. http://dx.doi.org/10.4321/S0004-05922012000400013.
[5] YIN, D.; LIU, H.; ZHANG, X.; et al. A protocol for extraction of high-quality RNA and DNA from peanut plant tissues. Molecular biotechnology, v.49, p.187-191, 2011. https://doi.org/10.1007/s12033-011-9391-9.
[6] OLIVEIRA, R.R.; VIANA, A.J.C.; REÁTEGUI, A.C.E.; et al. An efficient method for simultaneous extraction of high-quality RNA and DNA from various plant tissues. Genetics and Molecular Research, v.14, n.4, p.18828-18838, 2015. http://dx.doi.org/10.4238/2015.December.28.32.
[7] HUANG, C.; PICIMBON, J.F.; LI, H.Q.; et al. An efficient method for total RNA extraction from peanut seeds. Russian journal of plant physiology, v.59, n.1, p.129-133, 2012. https://doi.org/10.1134/S1021443712010074.
[8] JOHNSON, M.T.J.; CARPENTER, E.J.; TIAN, Z.; et al. Evaluating Methods for Isolating Total RNA and Predicting the Success of Sequencing Phylogenetically Diverse Plant Transcriptomes. PloS one, v.7, n.11, p.e50226, 2012. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0050226.